Au niveau national, l'UEPAL appartient à :
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- la Fédération protestante de France (FPF), regroupant les Églises luthéro-réformées de France ainsi qu'un certain nombre d'Églises évangéliques. Fondée en 1905, la FPF rassemble, en 2010, 26 Églises ou Unions d'Églises (dont 4 en probation) et 81 Communautés, Institution, Oeuvres et Mouvements pour un témoignage commun.
L'UEPAL est encore membre de :
- l'Alliance Nationale des Églises Luthériennes de France (ANELF) pour ce qui est de l'Église luthérienne,
- du Synode de l'Église réformée de France (ERF) pour ce qui est de l'Église réformée.
Au niveau européen et mondial, l'UEPAL :
- préside la Conférence des Églises Riveraines du Rhin (CERR), une section spécifique de la Communion d'Églises Protestantes en Europe (CEPE) rassemblant 104 Églises protestantes régionales
- participe activement à la représentation de la Conférence des Églises Européennes auprès des institutions présentes à Strasbourg.
Elle est membre de :
- la Fédération luthérienne mondiale pour l'Église luthérienne,
- la Communion mondiale d'Églises réformées,
- du Conseil Oecuménique des Églises (COE), rassemblant 349 Églises, dénominations et communautés d'Églises chrétiennes non catholiques romaines du monde entier.















